Лабораторная работа №11
ЭКСТРАКЦИЯ фосфопротеинфосфатазы
(ФПФазы)
ИЗ КЛЕТОЧНЫХ ЯДЕР СЕЛЕЗЕНКИ БЫКА
ФПФазы катализируют дефосфорилирование белков. Фосфорилирование же белков осуществляют протеинкиназы. Специфическое и обратимое фосфорилирование аминокислотных остатков в молекулах белков играет важную роль в регуляции метаболизма.
Существует очень большое разнообразие молекулярных форм ФПФаз, которые отличаются друг от друга субстратной специфичностью, кинетическими параметрами, субъединичным составом, локализацией и другими параметрами. В данной работе рассматривается ФПФаза клеточных ядер. Этот фермент обладает широкой субстратной специфичностью, катализирует дефосфорилирование не только фосфопротеинов, но и низкомолекулярных субстратов: АТФ, АДФ, пара-нитрофенилфосфата (пНФФ).
Способность ФПФазы дефосфорилировать пНФФ и его чувствительность к некоторым факторам, свидетельствует о том, что этот фермент является тирозиновой ФПФазой.
Часть 1. Выделение клеточных ядер методом дифференциального центрифугирования
Целью данного раздела работы является выделение клеточных ядер для дальнейшей экстракции из них ФПФазы.
В основе метода дифференциального центрифугирования лежит разность в скоростях седиментации частиц, имеющих разные размеры и плотность.
Реактивы: CH3COONa*3H2O, CH3COOH, KCl, MgCl2*6H2O, CaCl2, NaCl, HCl, сахароза, трис.
Оборудование: центрифуга, гомогенизатор, ножницы, капроновый фильтр, марля, весы, микроскоп, центрифужные стаканы.
Ход работы
Перед работой готовят следующие растворы.
1. Буфер А:0,3 МNa-ацетатный буфер рН 5,8. Этот буфер готовят из 2М Na-ацетатного буфера рН 5,8, который получают следующим образом:
CH3COONa*3H2O –255,8 г, CH3COOH (ледяная) – 7,2 мл. |
Объем доводят до1 л водой. |
2. Буфер В: 10 мМтрис-HCl, рН 7,55, содержащий 0,25 Мсахарозы, 25 мМKCl, 10 мМMgCl2:
трис –1,21 г, сахароза –85,5 г, KCl —1,86 г, MgCl2*6H2O –2,03 г, 0,1 н HCl – 80 мл. |
Объем доводят до1 лводой. |
3. Буфер С: 10 мМтрис-HCl, рН 7,55, содержащий 3 мМCaCl2:
трис –1,21 г, сахароза –85,5 г, KCl –1,86 г, CaCl2 –0,333 г, 0,1 н HCl – 80 мл. |
Объем доводят до1 лводой. |
4. Раствор Д:0,2 М NaCl:
NaCl –11,7 г |
Объем доводят до1 лводой. |
Клеточные ядра выделяют при температуре +4 оС.
Выделение ядер включает следующие этапы.
- После размораживания (2 –80 г) ткань измельчают ножницами.
- К измельченной ткани добавляют буфер В в соотношении 1 к 4. Затем ткань гомогенизируют в блендоре при максимальных оборотах 1 – 2 мин.
- Гомогенат фильтруют через 2 слоя марли, затем через капроновый фильтр. Фильтрация необходима для отделения неразрушенных частиц и фрагментов фиброзной ткани.
- Фильтрат центрифугируют при800 gв течение 7 минут. Центрифугат отбрасывают.
- Осадок промывают буфером В. Для этого осадок ядер суспензируют в буфере и затем центрифугируют при800 gв течение 7 минут.
- Осадок промывают буфером С, так же как в предыдущем случае. Этот этап необходим для лизиса эритроцитов.
- Осадок промывают раствором Д и затем буфером А. Очищенные ядра используют в дальнейшей работе.
Часть2. Экстракция ФПФазы из клеточных ядер
Для экстракции ферментов используют разные методы. К таким методам относятся: механическое разрушение ткани, ультразвуковая обработка, замораживание – оттаивание, использование различных соединений, которые способствуют салюбилизации ферментов и др.
Целью данного раздела работы является определение концентрации Na-ацетатного буфера, которая более всего подходит для экстракции ФПФазы.
Реактивы: 2М Na-ацетатный буфер рН 5,8.
Оборудование: центрифуга, гомогенизатор, центрифужные стаканы.
Ход работы
Для экстракции ФПФазы мы будем использовать 0,4, 0,6, 0,8 и1 МNa-ацетатный буфер рН 5,8. Эти буферы готовят из 2М Na-ацетатного буфера рН 5,8.
Для экстракции ФПФазы к осадку ядер добавляют 4- кратный объем буфера соответствующей концентрации. Осадок ядер тщательно суспензируют и оставляют на холоду на 20 мин. Далее суспензию центрифугируют, надосадочную жидкость используют в качестве препарата фермента. В пробах определяют активность фермента (лабораторная работа №12) и содержание белка (лабораторная работа №7). На основание этих данных рассчитывают общую и удельную активность препаратов ФПФазы. Результаты заносят в таблицу.
Концентрация буфера А, М |
Содержание белка, мг |
Общее содержание белка, мг |
Общая активность ФПФазы, ед.акт. |
Удельная активность ФПФазы, ед.акт./мг |
0,4 |
|
|
|
|
0,6 |
|
|
|
|
0,8 |
|
|
|
|
1,0 |
|
|
|
|
На основании полученных данных сделайте вывод, какую концентрацию буфера предпочтительнее использовать.